Santiago, Şili atık sularında çok az viral RNA kaybı olan SARS-CoV-2 tespit edildi

Share

Tweet

Share

Share

Email

Comments

Aralık 2019'un son günlerinden beri, Wuhan, Çin'de birkaç tanıdık pnömoni vakasının ortaya çıktığı günümüze kadar, 11.5 milyondan fazla vaka ve 500.000'den fazla ölümün nedensel ajan SARS- CoV-2, şimdi COVID-19 olarak adlandırılan bu hastalığın etkili gözetim ve yönetim yollarını bulmak endişe vericidir.

Kanalizasyon Salgını Tahmin Edebilir

Şili'den bir ön rapor, bir topluluk içindeki virüslerin dolaşımını değerlendirmek için hassas bir yöntem olarak kanalizasyondaki ciddi akut solunum sendromu koronavirüs 2'nin (SARS-CoV-2) tespitini tanımlamaktadır.

Temmuz 2020'de baskı öncesi sunucusu medRxiv * üzerinde yayınlanan çalışma, bunun yaklaşmakta olan bir salgını veya vakalardaki artışı uyarmak için önemli bir izleme aracı olabileceğini göstermektedir.

Şili'deki ilk vaka 3 Mart 2020'de tespit edildi. O zamandan bu yana 7 Temmuz 2020 itibariyle yaklaşık 300.000 vaka ile vaka sayısı arttı. Bu, 100.000 kişi başına 1.500'ün üzerinde bir orana geliyor.

Zirvenin, 220.000'den fazla vaka ve 100.000 kişi başına 2.700'den fazla kümülatif insidans oranının bulunduğu Santiago metropol bölgesinde olduğu görülüyor. Viral dolaşımın yoğunluğunu ölçmek için araştırmacılar, epidemiyolojik gözetim – atık sudaki virüsün tespiti için belirlenmiş bir yöntem kullandılar.

SARS-CoV-2'nin dışkı dökülmesi

Bu yöntem, hepatit A, hepatit E, vahşi ve aşıdan türetilen suşlar, norovirüs ve insan polyomavirüsü 2 de dahil olmak üzere çeşitli viral ajanların dolaşımını değerlendirmek için kullanılmıştır. virüs ile.

Dışkı dökülmesi genellikle ağırdır ve tipik olarak uzar. Viral yük viral RNA'nın en fazla 1 x 10 ⁶ kopyaya kadar gidebilir. Bununla birlikte, enfekte olmuş birçok kişi asemptomatiktir ve bu nedenle, solunum ve gastrointestinal sekresyonları ve atılımları yoluyla virüsü dökebilmelerine rağmen, hiçbir zaman teşhis veya tespit edilmezler.

Özünde, dolaşan virüs seviyesi sadece hastaneye yatmayı gerektirebilecek orta ila şiddetli semptomların ortaya çıkmasından veya enfeksiyonun erken saptanmasına izin vermek için kitle taraması yapılmadıkça bilinir. Bu, kanalizasyondaki viral yükleri tespit etme üzerine yapılan mevcut çalışmanın bağlamıdır. Bu aracın salgının gözetiminde oynayabileceği potansiyel rol, daha önceki bazı çalışmalar tarafından üstlenilmektedir.

Çalışma: Kanalizasyonda Virüs Tespiti

Mevcut çalışmada, iki atık su arıtma tesisinden (AAT) 24 saat boyunca toplanan kompozit ham kanalizasyon örnekleri kullanılmıştır. Bu bitkiler, yaklaşık 8 milyon nüfusa ev sahipliği yapan Santiago kentinden atık suyun yaklaşık% 85'ini toplar ve arıtır. Bu iki bitki, her biri için giriş ve çıkış kullanılarak aylık olarak Mart-Haziran 2020 arasında örneklenmiştir.

Örnekler steril polipropilen şişelerde toplandı ve her bir toplama gününde incelenmeye dikkat edildi. Araştırmacılar, muhtemelen vaka sayısının az olması nedeniyle, Mart ve Nisan aylarında toplanan tüm örneklerde virüsün bulunmadığını tespit ettiler. Kritik seviyenin altında, virüs tespit edilemez.

Yükselen Viral Yük Yükselen Durumlara Karşılık Geliyor

Mayıs ve Haziran ayları arasında alınan numuneler virüs için pozitifti, kopya sayısı daha önceki çalışmalarda rapor edilenlerle karşılaştırılabilecek aralıklar dahilindeydi. Ortalama döngü eşik değerleri yaklaşık 28 ila yaklaşık 38 idi. Genom kopyalarının sayısı her iki AAT'de Mayıs'tan Haziran'a kadar düzenli olarak arttı. Bu eğilim Santiago'daki teyit edilen vaka sayısındaki artışa karşılık geldi.

Bütün numuneler ayrıca insan polyomavirüsü 2 açısından da incelendi ve bunun için pozitifti. Bu virüs için geri kazanılan genomik kopya / ml aralığı, önceki açıklamalara benzerdi. Bu, izlenen prosedürün doğruluğunu teyit eder.

Sonuç ve Uygulama

Araştırmacılar, “Her iki AAT'de SARS-CoV-2 genom kopya sayıları, Mayıs ayından Haziran ayına kadar giderek arttı ve bu da topluluktaki tahmini virüs saldırganlarının sayısındaki artışla ilişkilendirildi.”

Virüsün dışkı yoluyla yayılması veya kanalizasyona maruz kalma yoluyla enfeksiyon kapma riski teorik bir olasılıktır. Bununla birlikte, virüsün çevrede uzun süre kararlı olup olmadığı belirlenmemiştir.

“Sonuçlarımız, kanalizasyondaki SARS-CoV-2 aramasının, semptomatik ve asemptomatik shedderler dahil olmak üzere, virüsün popülasyondaki dolaşımının tahmini bir göstergesi olarak kullanılabileceğini ve bu nedenle gösterildiği gibi bir erken uyarı sistemi olarak kullanılabileceğini gösterdi. yıllar önce dünya çapında çocuk felci virüsünün tespiti ve kontrolü için ”diye konuştu.

* Önemli Uyarı

medRxiv hakemli olarak gözden geçirilmeyen ve bu nedenle kesin, klinik uygulama / sağlıkla ilgili davranışlar konusunda rehberlik edilmemesi veya yerleşik bilgi olarak ele alınmaması gereken ön bilimsel raporlar yayınlar.